Le Formulaire Standard des données indique les spécificité du site. Vous pouvez le télécharger par ce lien : FSD Estuaire et marais de la Basse Seine.
Un grand nombre d'espèces visées à l'article 4 de la Directive européenne oiseaux y figure.
Outre son intérêt ornithologique indéniable, le site totalise plusieurs habitats naturels d'importance communautaire comme : estuaire, prés salés atlantiques et à spartine, végétations vivaces de rivages de galets, végétations annuelles des laisses de mer, dune mobiles embryonnaires, roselières de bordure dunaire et eaux oligo-mésotrophes à characées. Il s'agit aussi d'un axe pour les poissons migrateurs, de nourriceries pour les juvéniles de nombreuses espèces de poissons.